Bentuk lambang YPPQ Gresik adalah garis lengkung yang berupa 9 kelopak bunga.
Isi lambang : – Bumi – Menara – Pena dari bulu – Kitab
Arti lambang :
Bumi yang melambangkan ciri kelembagaan pendidikan dan merupakan sarana perkhidmatan civitas akademika YPPQ sebagai khalifah di bumi untuk mencapai tujuan YPPQ dalam rangka memperoleh kebahagiaan dunia akhirat
Kitab terbuka yang melambangkan upaya keberhasilan YPPQ di dalam menjalankan misinya di bidang ke-Islaman, Ilmu pengetahuan, Teknologi, budaya dan seni yang dilandasi keikhlasan, kejujuran, kerukunan dan keadilan.
Pena bulu dengan empat kelompok bulu melambangkan pemikiran yang tajam,kreatif dan cerdas sebagaimana khalifah nabi dan imam empat mazhab.
Lambang YPPQ Merupakan perkembangan lambang Yayasan diciptakan Oleh M. Rusydi , diresmikan pada tahun 1971.
